Die Amtsleitung AMB führt und koordiniert die vier Abteilungen an drei Standorten. 

• Die Abteilungen Finanzen/Administration/Wehrpflichtersatz und
  Militär/Kreiskommando an der Hauptgasse 70
• die Abteilungen Zivilschutz und Katastrophenvorsorge an der Baselstrasse 40 und
• die Abteilung Ausbildungscenter AMB-ziko in Klus Balsthal

Die Amtsleitung ist insbesondere für die Finanzen und die politische Mitverantwortung zuständig.
Sie ist zusammen mit der Militärdirektorin das Bindeglied zum VBS in Bern.